科研处是所务会领导下的一个执行机构，是所务会有关科研工作决议的执行者和推动者，代表所务会对计算所与科研相关的重大活动进行必要的策划、组织、协调和管理，为科研人员工作的开展提供所需的服务和支撑，规范计算所的科研工作。
科研处现在包括：科研规划办公室、科研管理办公室和科研支撑办公室。
科研规划办公室： 工作重点在于策划、组织、协调计算所对于国家重大项目和科研计划项目的申请及相关工作的开展。围绕计算所的近期、中期、长远三个阶段做科学发展战略及科研规划研究，军口和民口项目、资源的策划与争取，国际合作，学术管理，所内基金管理，CRM系统建设。
科研管理办公室： 主要负责对立项课题实施全过程的管理和服务。质量管理体系建设和质量控制、组织国家常规科研项目的申请、科研课题从立项到结题的过程管理、除知识产权以外的科技成果管理（鉴定、验收、登记、报奖、论文、论著等）、科研机构的管理（研究室、中心、联合实验室、虚拟课题组等）、研究所评估、课题考核、综合统计、财务管理、采购与外包的管理与控制等。
科研支撑办公室： 主要职责包括档案、资产、大型公共设备，及网络的日常服务及管理工作。同时还负有对所内有需求用户提出的有共性的科研支撑流程和科研平台进行建设的责任。 |
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